皇帝也不再直接参与政事，只代表国家祭祀天地祖宗，接见外国使者君主，奖赏有功臣民。
从现在开始，国家由大家选举出来的首辅次铺治理了。内阁是大明的政策执行机构，内阁的首辅次铺，必须由元老议政院提名。要求是必须当过地方县令，走过地方各级，或者从百户做起的军人，在地方政务历练三年，最终去职军权的军人，以保证有充分的地方执政经验。同时年纪必须满四十周岁，不超过六十周岁。如此，不但保证了没有年轻人的操切，有不因老迈而保守昏聩年富力强。
保证了这些之后，由皇上认可，皇上的认可是为了保证皇上的荣耀，又制衡元老议政院。
皇上可有三次反驳，再三次不能反驳成功，就必须遵从元老议政院的决断，再由大明三品以上的官员投票决定。
阁臣由首辅和次辅推选，再上交元老议政院评定，举手表决后才能施行。
首辅任期一届五年，可以连任三届，这样可以保证他推行的政策的连续性，不至于出现人亡政息。但三届候必须下台不得连任，这又保证了不因个人威信而出现权臣，不出现政久弊生。
他们干的好，大家让他干满十年。干的不好，直接将他弹劾下去，元老议政院再提名一个，再选一个就是了。皇上，基本算是一个看客。
但现在没皇帝不行，大家几千年的观念习惯在那里呢。没皇帝了，大家心中就感觉不安了，还是有一个在，比较让人心中踏实不是，虽然那不过是个名义上的。只要大家每年在皇帝的生日的时候，享受三五天假日，享受一个名正言顺喝一顿的节日就够了。
但这样的改革，就再也没人红着眼睛盯着那个皇位了，也就再也没有野心家行改朝换代的战乱痛苦，争夺皇位的自相残杀，将不再在中原大地上重复上演了，这才是根本。
想要执掌这个大明，实现你的野心，行啊，只要你好好的干，满足条件了你就能上去过把瘾，还干什么造反啊。
即便造反，其实也简单了，只要你有能力发动一场政变，将现任的首辅干倒就成了。发动政变好啊，成本小，危害小，然后就看你干的好坏了。干的不好，对不起，你白折腾了，因为还有一个皇帝的罢免跟着呢。玩也是白玩。
接着，新皇上的圣旨再次颁了一个让全天下奔走相告的特殊的条例。让所有天下皇家血脉的子孙，感激涕零的决断。再得到一次补偿之后，皇家宗室，凤子龙孙，都彻底变为庶民，废除对他们所有的约束，可以参与这个社会上的任何竞争谋生了。你可以考官，你可以带兵征战，你可以经商，你更可以务农，反正你和百姓一样奋斗，你可以达到除了皇帝以外任何目标。坐上首辅也不是问题。
后来大明的内阁首辅就从皇室中出了五个，而且做的非常好。
天下爵位为六等，王公候伯子男，但都是虚衔空壳，但非战功或治政优异者不可得。由元老议政院评定推举，由皇上赏赐。没有封地，没有俸禄，没有待遇，没有特权。除了一年一度皇上赏赐宴席之外，你什么也没有。
重建京营，但是定额只有一万，由皇室出资自己豢养，称为皇家仪仗队，由勋贵和朝臣子弟荣任。这支军队不参与实战，只负责保护皇室安全，以及出行仪仗。
皇室内帑与外朝彻底分开，每年国家由国库拨付二百万皇室赡养费用，此为定制，永世不得更改。而皇室的各个股份投资，原先的家产，以及收入，国家也不得再与觊觎。
国库没钱，想向皇上内帑伸手，那叫借。皇上借你，那是人情，不借你你也没辙。皇上收你利息，你也得挺着。
结果就有了后来一次皇上带着皇后堵着内阁大门撒泼耍赖讨债，最终将国家告上三法司法庭的事。没办法，最终朝廷不得不从银行贷款还债的事情出现。
但那时候，已经没有人指责皇帝的薄情寡义，反倒认为这样是理所当然。
官员的任免，由御史台考核，六科给事中评定，最终交给吏部举手表决通过。但三品以上，还必须交给内阁和元老议政院再次审核，最终举手表决通过。最终由皇上签署任免令，当然，这仅仅在说明，你是大明的官员，是大明皇帝的臣子。
而元老议政院和内阁的制度也有所改变。
元老议政院，是大明执政两驾马车之一，他是由退休致仕的国朝重臣以及勋贵公侯组成，由公推的德高望重宿老院长主持，第一届院长是德高望重的孙承宗。他主要的职责是监督内阁的运作。审核内阁提交新的政策的制定，弹劾罢免内阁成员。记住，这里只指弹劾罢免内阁成员，而不得干涉朝廷其他官员。其实就是给内阁拴上笼头，使得内阁不能胡作非为。
同时，一旦出现战争，元老院立刻转型为参谋部，让宿老发挥人老成精的特长，制定战略计划，行驶对带兵大将和兵部的监督，协调工部后勤的调配。
以上都是以精英推选而不是天下普选。这倒不是毛文龙改革不彻底，而是毛文龙依旧当时的国情，和后世的普选弊端，再大家吵架几天之后决定的。
一旦施行普选，一来民智未开，根本施行不了，二来的确是耽误功夫浪费精力。一个首辅或者是元老议政院的院长，为了上任，就要拿出一年的时间来向全国的老百姓宣传造势，然后为了保住位置，还要拿出功夫继续宣传自己。等下一届开始选举，就又要开始循环这样的操作。如此这个首辅不用做正事了，就整日为自己的事情忙吧。
皇上可以封驳提名，但只能有三次这样特权。皇帝有豁免权，即便是罪大恶极的，也必须执行。但每年只有一次
宣布朝廷以后政令依旧以皇帝圣旨为正名，但必须通过元老议政院，内阁署理才成为大明正式的政令，缺一皆为废纸。
撤销大帅总兵官永久带兵的权利。师以上的将军随时轮换绝不专属。
兵权交还给兵部，只有战争出现，由兵部指定任免将帅。