孙元化的三个儿子孙和鼎、孙和斗、孙和京照办了。在孙元化死后，他的遗体被儿子和部下迎葬于嘉定南门外的荒圩中，坟前立有一方石碑，上书“佥都御史孙元化墓”。此后，孙元化的三个儿子来到京城，把全部精力投入在整理父亲的遗作上，自己也不知不觉间变成了西洋火炮专家。
孙元化的三个儿子进京后，就住在汤若望的教堂里。
袁嘉升诚心诚意将汤若望和孙元化三个儿子那样的科学人才笼络到麾下，为自己所用。
袁嘉升派锦衣卫找到了汤若望，他此时正在京城宣武门内原天主堂里工作。那天晚上，月明星稀，袁嘉升带着满黑龙、何勇智等人微服造访。
“恭迎圣上，万岁，万万岁!”穿着一身黑色神父袍的汤若望见皇帝亲自登门，还是晚上，料定有重要的事情发生，用生硬的汉语行礼道。
汤若望知道，要想在中国传教成功，必须结交中国的权贵，学习中国的语言文字，并尊重中国人敬天、祭祖、祀孔的礼仪习俗，而“最善之法莫若以学术收揽人心”，他对袁嘉升的到来抱有极大的善意——明朝在这时候绝对是一个泱泱大国，人口过亿，教徒发展潜力巨大。得到明朝皇上的重用，以后必然会对他的传教事业大有好处。
“汤神父，好久不见，免礼吧。”袁嘉升看着眼前这个大胡子的神父，说。
“皇上找我有事，宣召我入宫便是。”汤若望不明白袁嘉升来找他的意图。
“神父，还记得大约十年前，朕命你以西法督造战炮吗你口述有关大炮冶铸、制造、保管、运输、演放以及火药配制、炮弹制造等原理和技术，由焦勖整理成《火攻挈要》二卷和《火攻秘要》一卷。这两本书朕近日看了一下，很是不错。根据兵部的记载，你当年奉旨设厂铸炮，两年中铸造大炮二十门，后来怎么没下文了”
“因为大明的生铁不好，容易炸膛，成本太高了。”汤若望用生硬的中国话回答袁嘉升。
“哦，原来大明火炮不行，是这个原因。你有办法改进么”袁嘉升点点头，问汤若望。
作为冶金专业的大学生，袁嘉升知道，钢铁是近代工业之母，武器离不了，一旦生铁质量过关，这时代各种有趣的创新和发明其实都可以应用。比如想要制出近现代的弓弩出来，首要就是炼出更好的铁，弄出更好的木料。还有西洋火炮，其实明末近代意义的火炮已经成熟，可问题在于，由于炮身的铸铁工艺技术不过关，不但精度极差，射程也不如意，时不时还炸膛，有是还不如满清铁骑的射箭好用。而且明末火炮虽然有了应用，但是真正大规模的应用却没有真正铺展开。其中最大的难题，也就在于此。
汤若望道：“这些年欧洲的炼铁技术进步很快。改进的方法是有的。”
“太好了。今天朕来找你，是想让你重启大明火炮厂，重建火器营，为大明研制新式的火器。”袁嘉升说明了来意：“你要什么官职和条件，只管开口。”
“我只有一个条件。”汤若望想了想，回答袁嘉升道：“除非皇帝答应我这件事，否则我就是死，也不会再为大明效力。”
袁嘉升看了一眼汤若望，说：“你是要朕为你的朋友孙元化平反吧，此事非同小可啊，十余年前的旧事了。而且孙元化的死，牵涉面甚广，尤其是涉及到袁崇焕。不过，是朕错了，朕有愧于孙家，即便朝臣们有阻力，朕也会竭力为孙元化平反！”